互芯平台是什么系统 互芯平台的系统介绍

互芯平台是什么系统

互芯平台是一款由上海华大基因研发的基因测序数据分析与挖掘的云计算平台。它提供了全基因组测序、外显子测序、RNA测序、单细胞测序、甲基化测序、ChIP测序等数据分析服务，以及各种分析结果的可视化呈现。

平台功能

1、数据上传与格式转换：互芯平台支持用户将FASTQ、BAM等格式的原始数据上传至云端经过格式转换。同时，在上传数据时用户需要填写样品信息，方便后续分析。

2、测序数据分析：互芯平台提供多种数据分析服务，如SNV/INDEL分析、拼接变异分析、差异表达分析等。平台支持的分析流程集成了最流行的测序分析工具，如BWA、GATK、TopHat、Cufflinks等，并且还支持用户自定义分析流程。

3、结果呈现与导出：互芯平台的分析结果都可以通过平台上的交互式可视化图表进行查看。用户还可以将结果导出成PDF、Excel等格式进行存储。同时，平台还支持用户将分析结果直接导出到IGV中进行进一步的验证。

平台优势

1、灵活性高：互芯平台集成了多种测序数据标准分析流程，并且支持用户自定义分析流程，可以满足用户不同的研究需求。

2、分析结果可视化：平台提供交互式的图表，使得用户可以更直观地查看分析结果，并且支持结果导出为PDF格式、Excel格式等，方便用户进行存储。

3、云计算优势：用户无需购买昂贵的计算机设备，也不需要担心数据存储和备份，只需要上传数据并进行分析即可。同时，互芯平台使用上海华大基因自己研发的云计算基础设施，保证了计算速度和数据安全。

应用场景

1、生物医学研究：互芯平台可以用于全基因组测序、外显子测序、RNA测序、单细胞测序、甲基化测序、ChIP测序等多个领域，可以帮助研究人员在疾病诊断、药物开发、分子生物学研究等方面提高研究效率。

2、临床诊断：互芯平台可以帮助医生进行肿瘤分析、遗传病诊断等方面的分析，为临床诊断提供帮助。

3、教学科研：互芯平台可以为学生提供实验设计、测序数据分析和结果解读方面的培训，帮助学生掌握相关技能。