1、柑皮不同
小青柑：指在树枝柑果皮未着色，生理未成熟时（通常指农历立秋至秋分）采收果实所加工的皮，此时橙皮甙[dài]含量较高，多糖的含量较低，油室则较小而并不十分饱满；果皮青绿色，陈皮色泽青褐色至青黑色，质硬、皮薄，味辛苦、气芳香，耐贮。
大红柑：指用新会柑（通常指立冬至冬至前后采收，果实已成熟）果实所加工的皮，此时橙皮甙含量较，,多糖的含量较高，油室则大而饱满；果皮色泽鲜红色至大红色，陈皮色泽棕红色至棕黑色，质软、皮厚、性温，味甜香，不耐贮。
2、滋味不同
小青柑处于生长的“青年”期，果胎硬且皮薄，味辛气香，所以用小青柑制作的柑普茶一般比较辛香，清新可人。细品小青柑普洱会发现，其滋味略有水汽，生津无回甘，风格清新，青柑味重，几乎遮掩住了普洱茶的味道。因为质硬味香，且辛辣留存，苦味未退，所以适合储藏。
大红柑皮厚、色深、性温和，大红柑皮糖分很高，用大红柑陈皮制作的柑普茶，口感较为甜润，对胃肠刺激性行对要弱。
细品大红柑则发现：陈皮香浓郁，同时可以明显体会到普洱茶味，相对青柑，较甜。同时有一定润感，相对青柑有一些厚度，总体可以形容为普洱和陈皮结合相对略好，喝起来很舒服。
3、内质不同
小青柑和大红柑相比，内含物质最大的不同在于，小青柑挥发性果油（柠檬烯）和果酸（柑橘酸）含量高。
柑橘酸：是果酸的一种，是一种对皮肤有益的营养物质，对皮肤有良好的滋养作用。柠檬烯：具有良好的镇咳、祛痰、抑菌作用，复方柠檬烯在临床上可用于利胆、溶石、促进消化液分泌和排除肠内积气。
大红柑和小青柑相比，内含物质最大的不同在于，大红柑果香类芳香物质含量高，含海绵松丝较多，果糖含量高。
海绵松丝：较好的膳食纤维，能够帮助肠胃蠕动助消化、对于调节膳食平衡有较大的助益，且富含多种维生素。
果香类芳香物质：大红柑成熟度高，果香类芳香物质含量高，据研究表明，植物中芳香物质，对于控制中度、轻度高血压患者血压，具有实际效果。
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