嵌入式系统是由微处理器或微控制器组成，程序员需要使用编程工具来编写唯一的程序代码，进行调试和联调。常见的编程工具有IAR Embedded Workbench，Keil µVision，GNU Compiler Collection（GCC），Code Composer Studio，Atmel Studio等等。这些编程工具都提供了完整的编程环境，内嵌代码编辑器、调试器、编译器、仿真器、硬件配置等多种功能。
其中，IAR Embedded Workbench被认为是适用于性能、效果和可靠性的工具，Keil µVision适用于单片机，Arduino开发环境则适用于小型项目。当然，使用哪种编程工具不止取决于具体开发需求，还需要根据个人技术和经验层面的考虑。
版本控制工具可用于团队协作或个人开发，对代码的版本进行管理和记录，以防止代码意外修改所导致的问题。版本控制工具将所有变更记录起来，可以回溯先前的代码版本和修改历史。最常用的版本控制工具是Git。除了Git，还有Subversion，Perforce，CVS等版本控制工具可选择。
Git是一个分布式的版本控制系统，可以轻松地管理大型项目和协作开发。它提供完整的命令行和图形界面工具，使用户可以更轻松地跟踪所有的开发历史。除此之外，还有一些其他的Git工具集，如GitHub、GitLab、Bitbucket等，它们都提供了版本控制、代码托管、自动一体化等各种功能。
仿真工具和评估工具是进行嵌入式开发的关键。在开发过程中，需要进行实验室测试来验证所编写的代码，这样可以在运行代码之前找到可能的问题和漏洞。很多公司提供了专业的测试和评估工具，如Bochs，QEMU，VirtualBox，VMware等等。
此外，还有一些仿真器可以模拟各种I/O设备、传感器以及外部接口的交互。像Proteus、LabVIEW、MATLAB和CircuitMaker，这些软件集成了仿真器和设计工具，可以快速，准确地验证系统的设计。
嵌入式开发需要掌握具备一定的算法和信号处理技巧，比如数字信号处理和信号处理算法优化。现在很多厂商和开发者都提供了面向DSP和算法开发的工具来处理这些任务，这些工具在算法开发过程中显示出了优异的性能。
工业级的DSP和算法开发工具，包括MATLAB，DaisyDSP和Wolfram Mathematica等软件，他们为代码提供了重量级的数学库。同时，还提供了Tensilica等专为嵌入式系统设计的平台，这些平台使用的是针对DSP和算法优化的体系结构，能够更好地适应嵌入式应用场景。
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