非侵入式注入是指在不需要进行任何外科手术的情况下将脑机接口设备放在人体头部，在不破坏人体的前提下进行信号采集和处理。这种方式相比于侵入式注入更加安全，不会对人体造成伤害和损失。但是由于设备的限制，非侵入式注入在信号采集和识别上存在着一定的局限性。
侵入式注入是指将脑机接口设备通过手术实现植入到人体大脑或神经系统的方法。这种方式相比于非侵入式注入更加精确和灵敏，信号采集的准确度和信号处理的速度都会更高。但是由于手术的风险和病人的收入成本，这种方式并不普遍使用。
混合注入方式是指将侵入式注入和非侵入式注入结合在一起，通过人体的短时切口进行设备的放置和信号采集。这种方式相比于单一方式，信号采集的精确度更高，且不需要进行比较复杂和费用高昂的手术。目前，混合注入方式在治疗一些列难治性疾病方面已经被广泛使用。
除了以上三种注入方式之外，还有一些不太传统的注入方式，如：经皮颅磁刺激注入、经颅磁刺激注入等，这些方法也符合脑机接口的原理，但是目前的研究和应用相对较少，尚未达到实用化的程度。
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