捕鱼器电鱼的原理是通过电流麻痹鱼类神经导致其失去游动能力，然后被捕捞上来。而鱼被麻痹的程度，与电流通过鱼体所形成的电压和电流强度有关。在捕鱼器里，电流是通过在水中传播的。如果在水中释放出的电流密度过大，就会对周围的鱼类和水生生物造成不可逆的损伤。因此，在捕鱼器中，要求以尽可能小的电压高密度地释放电流。此时，对于相同的电压，如果鱼的体积更大，会使处于鱼体中的电流分布更加平均，导致麻痹的程度降低。因此，对于同样的电压，大型鱼可能不容易被麻痹。
一般而言，捕鱼器有两种方式释放电流：直流和交流。直流电势稳定，没有频率，传递的电流也相对较均匀，因此直流电捕鱼器释放的电流密度会比较高。交流电具有频率，一般会在每秒数百次左右的频率内变化，这种变化会使电流更加容易穿透鱼类体表进入其内部。同时，鱼类身上的电受到交流电的刺激更容易达到临界值，从而更容易发生麻痹。因此，相对于直流电，交流电更容易麻痹大型、小型鱼，是一种更加普遍的捕鱼器释放电流的方式。
除了体积因素和电流释放方式之外，鱼所处的环境和其身上的成分也会影响捕鱼器的效果。例如，在深度较浅的水中，水体中的盐度通常更高，释放的电流密度可能更大，鱼类也更容易被麻痹。同时，如果捕鱼器使用的电流被一些特殊的机理（如分解水分子而产生的电），影响鱼类电影，那么鱼被麻痹的效应也将相应增强。
电鱼捕捞虽然是一种较为高效的捕鱼方式，但是在实践中也造成了很多生态损失。由于捕鱼器通常能够捕捞各种规模的鱼类，其中不乏一些已成年而未繁殖的成年鱼、甚至是稀有物种。如果这些鱼被电死了，将直接影响河流中这些物种的数量。此外，如果过度捕捞，还会影响水生物种群的平衡，进一步产生生态后果。
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