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基因组图谱

基因组图谱是展示一种生物全基因组结构的图谱。按建立图谱的研究目的方法和精细程度,可以有不同的形式,包括以遗传学方法建立的遗传连锁图谱,按距离绘出基因位置分布的物理图谱,经测定核酸序列建立的核苷酸怎积士名较行饭主序列图谱,以及标记出可表达序列的转录图谱等。

前言

来自  首个完整的中国人基因组图谱“炎黄一号”近日在深圳盐田绘制完成。昨照仅备具并德复孙日,在第九届高交会开幕之际,中国科学家首次向全世界予以发布。这也是第一个黄种人全基因序列图谱。360百科专家表示,这项在基因组科学领域里程碑式的科学成果,对于中国乃至亚洲人的DNA、隐形疾病基因、喜示术根度车落花流行病预测等领域的研究具有氧拉茶或夫著案季类重要作用。

背景

基因组图谱

 王别保盾突挥 人类基因组图谱被免后汉技若独微衡誉为“人体的第二张解剖图”,通过分析人体24条染色体的碱基序列,获得个人基因组,超判苗假气还而有助于预防遗传疾病,为新药物研制以及新医疗方法提供依据。

  此前,耗资30亿美元,多科学家共同努力成功绘制了国际人类基因组计划。人类基因组计划,也因其对预防治疗遗传疾病、破解人类遗传密码具有里程碑式的意义,与曼哈顿原子弹计划、阿波罗登月计划,被并称为20世践坐历层担祖角纪的人类自然科学史上三大科学计划。

  但是,已公布的基因组图谱,都是以白种人为主要研究对象。而已有的基因组研究进展表明,不同人种之间的基因多态性即基因差异客观存在。这些看似微不足道的差异,很可能在保健、红连皮受疾病诊断乃至治疗等方面产生十分关键的影响。

炎黄一号

  因此,黄种人基因组图谱掉城子数改需的绘制十分必要,同时将产生重大产业影响。而我国在人类基因领域的研能十用滑找染权究上,一直位于世界前列。此前,我国科学家就曾出色地承担了国际人类基因组计划1%的任务和国来自际人类单体型图谱10%的任360百科务。

基因组图谱

  为掌握分析黄种人的基因图谱,旨在绘制首个完整的中国人基因组图谱的“炎黄一号”计划今年在深圳启动。该项目由深圳华大基因研究院、生物信息系统国家工程研究中心及中国科学院北京基因组研究所共同发起承担。研究中得到了中国科学院、国家发改委、科技部、自然科学基金委、深圳市政府、盐田区政府的大力支持。

  经过历时半年的研究,百余名中国科学家共同完成了“炎黄一号”的绘制,这也是首个100%由中国人分析完成的基因组图谱。昨日,在第九届高交会开幕之际,研究组召开发布会首次向全世界发布。

诞生过程

  ●去年11月19日,中科院昆明分院、华大基因、中国科学院北京基因组研究所、大百汇集团、云南西双版纳州相关负政速发脚至二找次搞责人及科学家相聚昆明,产生绘制首张黄种新哪搞始四满问代制利宜人基因图谱的想法,并把开展地选在深圳。

  ●该想法得到了深圳市政府和盐田区政府的高度重视和支持。

  ●今年6月,120余名科学家正式进驻深圳华大基因研究院,开始图谱测序工作。

  ●进行海量数据分析收认件等婷而参计算。

  ●图谱近日绘成,昨日向世界公布。

观甲述获局强五大奇迹

  ●成本较低:仅耗资60多万美元。

  ●人员年轻:平均不到留济尽武点菜尼35岁,其中25%是博士和“海归”。

  ●时间短暂:半年。

  ●准确间走走光争法探术足前材度高:提高5―10倍。

  ●误差率小:达到5万―10万分之一。

计划

  研究组专家昨日介绍,“炎黄一号”计划能够历时半界不罗年就完成绘制,新技术的运用是重要因素。今年以来国际科学界在DNA测序技术上取得新的进步,极大加速了解码生命的进程,降低了成本。相比于多年前国际人类基因组计划耗资30亿美元,此次“炎黄一号”计划的研究成本仅用了数十万元美元。专家表示,随着DNA测序技术的不断进步,基因测序的成本将有望继续降低。

  今年,国外已经宣布完成个人基因组图谱的有两人,分别是诺贝尔奖获得者、“DNA压众协顺破主修收如掉损之父”詹姆斯?沃森和基因组研究先锋CraigVente好笔玉门业选r.据华尔街投资血微家预测,这些重量级人物的基因组图谱的绘制,预示着个人基因组时代的大幕已经拉开。

  昨日,研究组宣布随着“炎黄固际多排为养尼一号”计划的完成,将启动“炎黄99”计划,将进行上百个己雨乃至更多的个体基因组分析,发现黄种人种群的基因兰弦视川跑球其养听组多态性的规律性。志愿者中包蒸编感路联第得真我办扬括汉族、少数民族和东亚其他国家和地区的人,现正全面征集有意为基因与健康事业作贡献的人们加入这一项目中来。

未来医学

  “炎黄一号”计划的主要负责人、深圳华大基因研究院副院长王俊博士认为,随着基因测序技术的成熟和成本的降低,10年后人们可能这样治病:花1000美元得到自己的基因组图谱,然后通过临床医学找到致病基因,再有针对性地通过改变生活习惯、药物治疗等方式对付疾病。

  届时,那些动辄需要上万元医疗费、像先天性心脏病之类的遗传性疾病,可能只要花几千元就可以轻松治愈

谷子基因图谱

  中国领先绘出谷子单倍体型基因组图谱

  由中国农业科学院作物科学研究所、中国科学院上海生命科学研究院国家基因研究中心、中国科学院遗传与发育生物学研究所等8家单位联合组成的科研团队,在国际上率先完成了谷子单倍体型图谱的构建和47个主要农艺性状的全基因组关联分析,相关成果6月24日在线发表于《Nature Genetics》(《自然-遗传学》)上,标志着我国在谷子遗传学研究领域取得了重要突破。

  据项目负责人、中国农科院作科所刁现民研究员介绍,谷子是起源于我国的古老作物,脱壳后为小米。我国的谷子资源占世界存量的80%以上。但长期以来,科研人员对这些遗传资源的群体结构缺乏了解,进而限制了对谷子基因资源的高效发掘和深度利用。

  该项目成果为谷子的遗传改良及基因发掘研究提供了海量的基础数据信息,将促进谷子发展成为旱生禾本科和高光效作物光合作用研究的模式作物,丰富禾谷类作物比较遗传学与功能基因组学的研究内容,同时也将对未来禾谷类作物的品种改良、能源作物的遗传解析产生深远的影响。

  1月16日,中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所韩斌研究组、上海师范大学黄学辉研究组,以及中国水稻研究所魏兴华研究组合作,研究成果以Pan-genome analysis highlights the extent of genomic variation in cultivated and wild rice为题,在线发表在《自然-遗传学》上。该研究首次绘制了栽培稻-野生稻的泛基因组图谱,系统鉴定了涵盖各类群水稻的编码基因集,其中很多新鉴定出的基因在各类群水稻中呈现出丰富的“存在-缺失”变异,研究成果以长文形式发表。

  研究团队选取了66个来自不同水稻类群的栽培稻品种和野生稻株系,进行深度测序、从头序列组装和基因注释分析,获得水稻各类群材料的精细基因组图谱,鉴定出水稻基因组中各类复杂的遗传变异,发现很多功能基因存在有多种等位基因类型。此外,该研究系统鉴定到栽培稻和普通野生稻中几乎饱和的编码基因集及其在不同品种中的“存在-缺失”变异;其中新鉴定的很多编码基因存在有转录产物和蛋白质功能结构域,暗示可能存在一定的生物学功能。该研究成果将有助于精确发掘复杂农艺性状的关键变异位点,有力推动水稻的功能基因组学研究;此外,该研究将有助于育种家充分利用各类群水稻中丰富的遗传变异,为进一步提升我国水稻的产量潜力、抗逆特点等提供了重要的基础信息。

  研究工作得到了国家自然科学基金委重大研究计划、科技部国家重点研发计划及中科院战略性先导科技专项等的资助。

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