清骨散出自《证治准绳》。清骨散所治之证乃阴虚生热，热扰内外所致。阴虚生热，热蒸内外，则骨蒸潮热，或低热日久不退；虚热内生，热灼阴津，则形体消瘦；虚热上扰，则两颊潮红；虚热迫津外泄，则盗汗；虚热充斥四肢，则手足烦热；虚热伤气，则肢体困倦；舌红少苔，脉细数，皆为阴虚生热之征。治当清退虚热，凉血养阴。
方中银柴胡性甘苦微寒，直入阴分而清热凉血，善退虚劳骨蒸之热而无苦燥之弊，为君药。知母泻火滋阴退虚热；胡黄连入血分而清虚热；地骨皮凉血而退有汗之骨蒸，三药俱入阴退虚火，以助银柴胡清骨蒸劳热，共为臣药。秦艽、青蒿皆辛散透热之品，清虚热并透伏热使从外解；鳖甲咸寒，既滋阴潜阳，又引药入阴分，为治虚热之常用药，同为佐药。使以甘草，调和诸药，并防苦寒药物损伤胃气。本方重在清透伏热以治标，兼顾滋养阴液以治本，并收退热除蒸之效。
临床应用以午後或夜间潮热，骨蒸心烦，两颊潮红，手足心热，或低热日久不退，形体消瘦，盗汗，舌红少苔，脉细数为辨证要点。
现代临床，清骨散用于治疗肺结核、小儿夏季热、创伤性发热、内分泌失调发热、产后发热、急性白血病、不明原因发热等病症。随证加减：若血虚明显者，加当归、熟地黄，以滋补阴血；若阴虚明显者，加麦冬、玉竹，以滋养阴津；若内热甚者，加生地黄、赤芍，以凉血清热；若大便干结者，加阿胶、大黄，以补血通下等。
临床运用注意事项：①阴虚与骨蒸，依据虚火不降，阴液无以内守，以降火为先，骨蒸潮热不除，滋阴难以见效；②患者常有各种兼症，均应分别随症加减对症之药，组方仍以清降虚火为主；③不同病因的发热，剂量应有差异，迁延日久或热伏骨髓，或骨蒸潮热重者，剂量宜大，以方中青蒿为例，可多达30克。新病轻症及产乳者，多用常量；④本方退热作用较强，而滋阴作用较弱。若阴虚较甚、潮热较轻者，不宜使用；⑤清骨散以清虚热药为主，易伤正气，中病即止，不宜长时间应用；⑥湿热内蕴者慎用。
清骨散与青蒿鳖甲汤皆能治疗阴虚发热。青蒿鳖甲汤以青蒿、鳖甲为君，配伍生地、知母，是养阴与透邪并进，治热病伤阴或温病后期，邪伏阴分之证，无汗；清骨散以清虚热药物为主组方，治阴虚内热之骨蒸潮热，盗汗。
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