1、鲜藏：新鲜的平菇在室温下贮藏的时间受温度和空气湿度的影响较大。室温在3℃-5℃，空气相对温度在80%左右时，鲜菇可贮存一周。温度增高，湿度也要增加。菇量不多时，可将平菇放于装有少量冷水的缸内，并将缸口封严，气温即便达到15℃-16℃，也可保鲜一周左右。还可将菇完全浸于冷水中，但水必须干净卫生，水的含铁量应低于2毫克/升，这样平菇才不会变黑。
2、冷藏：将新鲜的平菇子实体在沸水中或蒸汽中处理4-8分钟，放到1%柠檬酸溶液中迅速冷却，沥干水分后用塑料袋分装好，放入冷库中贮藏，可保鲜3-5天。
3、气调贮藏：采摘后的鲜菇仍在进行呼吸，吸入氧气，放出二氧化碳。适当降低环境中氧气的浓度，增加二氧化碳的浓度，可以抑制呼吸作用，延长保鲜期，平菇在低温下可耐25%的二氧化碳浓度。在气调室内，要达到所要求的气体指标，有一个降氧气和升二氧化碳的过程，降氧期越短越好，这样贮藏的菇体可尽快脱离高氧化的环境，获得最佳的气调效果。
4、化学贮藏：可用来贮藏平菇的化学药品主要有0.1%的焦亚酸钠、0.6%的氯化钠、4毫克/升的三十烷醇水溶液、50毫克/升的青鲜素水溶液、0.05%高锰酸钾水溶液、0.1%草酸等。具体方法是：先将鲜平菇修整干净，放入药液中浸泡1-5分钟，捞出沥干分，分装入0.03毫米厚的聚乙烯塑，袋中，扎紧袋口进行贮藏。
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